O programa apoiará a pesquisa básica e aplicada sobre biocombustíveis, criando conhecimento fundamental para a produção sustentável e aplicações baseadas principalmente em etanol de cana-de-açúcar. O bioen inclui pesquisa acadêmica básica e pesquisa aplicada em colaboração entre universidades e empresas.
A abertura será feita pelo diretor científico da Fapesp, Carlos Henrique Brito Cruz.