Depois de dois anos à frente da Secretaria de Assuntos Estratégicos, Mangabeira Unger deixa o governo para voltar à Universidade de Havard, nos Estados Unidos, onde é professor há 40 anos. Na carta de demissão, enviada ao presidente Lula, a saída foi justificada pela necessidade de retomar a vida acadêmica e a convivência com a família.
O relatório das ações da Secretaria feito pelo ministro cita o processo de regularização fundiária como uma revolução para a Amazônia.
Mangabeira Unger teve a gestão marcada por polêmicas na área ambiental, principalmente por causa do andamento do Plano Amazônia Sustentável, criado para definir diretrizes sobre o desenvolvimento da região. Ele vai ser substituído provisoriamente pelo secretário executivo da pasta, Daniel Vargas.