A estratégia da Amyris é utilizar hidrocarbonetos da cana para produzir farneseno, uma molécula que pode ser transformada em várias especialidades químicas, lubrificantes e combustíveis, a partir de sua mistura com fermentadores específicos produzidos pela Amyris. A Amyris também possui parceria com a Biomin Nutrição Animal, onde a produção de farneseno já está em operação, com produção de 300 mil litros mensais.
No segundo trimestre de 2012, a unidade que a Amyris está construindo em joint venture com o Grupo São Martinho, a SMA Indústria Química SA, entra em operação. O acordo utilizará, inicialmente, um milhão de toneladas de cana-de-açúcar fornecidas pela Usina São Martinho, localizada no interior de São Paulo, para a produção do farneseno. A previsão é de produção de 92 milhões de litros no primeiro ano na unidade da São Martinho. Os investimentos na SMA são de US$ 35 milhões.
Na usina Paraíso Bioenergia, a produção também começará em 2012. Localizada em São Paulo, a expectativa é de que a nova empresa processe o caldo de até um milhão de toneladas de cana por ano. A expectativa é de que a planta, que será construída pela Amyris ao lado da usina Paraíso, entre em operação em 2012.
Diferente dos demais acordos, a Novvi, joint entre Amyris e Cosan prevê, inicialmente, que ela obterá farneseno de outras instalações de produção da Amyris para a produção de óleos básicos, como o que será utilizado na linha de lubrificantes EvoShield.