O início do prazo de vigência do sistema foi prorrogado de 1º de janeiro de 2009 para 31 de dezembro de 2009, conforme instrução normativa publicada nesta segunda, dia 13, no Diário Oficial da União. A certificação tornou-se obrigatória a partir da publicação do decreto número 3.855/2001.
Segundo o diretor do Departamento de Infra-Estrutura e Logística da Secretaria de Desenvolvimento Agropecuário e Cooperativismo do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Mapa), Biramar Lima, a prorrogação do prazo é necessária para solucionar questões operacionais.
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No Brasil, são cerca de 16 mil unidades armazenadoras, com capacidade estática total de 126 milhões de toneladas. Até janeiro de 2009, de acordo com ele, não haveria tempo suficiente para o credenciamento de todas pelos Organismos de Certificação de Produto (OCPs), acreditados pelo Inmetro.
