As unidades são centros de pesquisa e gestão do uso dos recursos pesqueiros do Nordeste (Cepene), Norte (Cepenor), Sudeste e Sul (Cepsul) e o Centro de Pesquisa e Gestão do Uso dos Recursos Pesqueiros Lagunares e Estuarinos (Ceperg).
Os centros voltam a ser administrados pelo Ibama, que assume as obrigações, os direitos e acervos técnicos, materiais e patrimoniais. Eles foram repassado para a estrutura do ICMBio em 2007, na época da criação do instituto, juntamente com outros centros especializados em fauna e flora.
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Com o ICMBio, permanecem nove centros de pesquisa e conservação: Tamar (tartarugas marinhas), Cemave (aves silvestres), RAN (quelônios da Amazônia), Cenap (predadores), CPB (primatas), Cecat (cerrado e caatinga), Cepta (peixes continentais), Cepam (Amazônia), Cecav (cavernas), CMA (peixe-bois e cetáceos) e CNPT (populações tradicionais).
