Plantas de alto desempenho permitem o melhor aproveitamento do adubo e dos herbicidas, ou seja, melhor controle de ervas daninhas. Segundo Francisco Krzyzanowski, pesquisador da Embrapa Soja, pesquisas indicam que essas plantas também podem produzir até 25% a mais de vagem, o que resulta em até 35% de aumento de produtividade.
Por outro lado, se o produtor usa semente de qualidade inferior, o produto final será um óleo com mais acidez, com custo maior de produção e um farelo de pior qualidade, por exemplo, o que provoca a desvalorização da matéria prima ofertada no comércio.
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